OTTAVI DI FINALE
andata 02/09/2012 – ritorno 20/09/2012
Terlizzi – Atletico Corato 0-0 (0-3 dcr) (And.0-0)
Manfredonia – Atletico Vieste 1-1 (And.2-0)
Manduria – Copertino 2-0 (And.2-2)
Pro Italia Galatina – Gallipoli 0-2 (And.4-2)
Quartieri Uniti Bari – Libertas 3-3 (And.0-2)
Atletico Mola – Polimnia Calcio 1-1(5-3 dcr) (And.1-1)
Atletico Tricase – Real Racale 0-1 (And.3-1)
Audace Cerignola – San Severo 0-0 (And. 1-0)
QUARTI DI FINALE
andata 11/10/2012 – ritorno 25/10/2012
Atletico Corato – Libertas 2-1 (And. 0-3)
Audace Cerignola – Manfredonia Calcio 2-1 (And. 1-1)
Manduria Sport – Atletico Mola 2-1 (And. 2-3)
Atletico Tricase – Pro Italia Galatina 1-1 (And. 0-0)
SEMIFINALI
andata 08/11/2012 – ritorno 22/11/2012
Pro Italia Galatina -Manduria 2-0 (And. 3-1)
Libertas Molfetta – Audace Cerignola 1-0 (3-4 d.c.r.) (And. 0-1)
FINALE REGIONALE
gara unica 13/12/2012
Pro Italia Galatina – Audace Cerignola 1-2